K rekonstrukci koryta se přistupuje v těch případech, kdy stávají profil koryta je historicky zdegradován, kdy jeho stabilizační prvky opevnění již nevyhovují a jsou dožité. Při rekonstrukci koryta se bere v úvahu jeho původní kapacita, na kterou se zpravidla průtočný profil obnovuje. V zastavěném území se v převážné míře rekonstrukcí koryta stává přestavba původních historických nábřežních opěrných zdí, které již pozbývají svoji stabilitu.